在儿科，医用灌肠器主要用于治疗便秘或进行肠道检查/手术前准备，极少用于腹泻治疗。腹泻本身是肠道清除有害物质或病原体的一种机制。在大多数情况下，腹泻不需要灌肠。如果需要灌肠，通常是出于诊断目的（如收集粪便样本）或在极少数特殊情况下辅助排出肠道内积聚的毒素或药物（但风险高且不常规）。

在极少数可能需要使用灌肠器的情况下的“正确操作方法”（需严格遵医嘱）：

明确灌肠目的和必要性： 必须由儿科医生评估腹泻原因、严重程度，并明确灌肠的具体目的和必要性，排除禁忌症。

选择温和的灌肠液和极少量： 如果需要，医生可能会指定使用生理盐水或温清水，并且用量会非常少，远低于便秘治疗时的剂量。

使用儿童/新生儿专用灌肠器： 根据患儿年龄，选择容量小、头端柔软的专用灌肠器。

操作极其轻柔和快速： 患儿腹泻时肠道黏膜可能处于炎症状态，操作必须极其轻柔，减少刺激。插入深度很浅，注入速度要慢。

密切观察反应： 腹泻患儿更容易出现电解质紊乱和脱水，灌肠可能加重。必须密切观察患儿的生命体征、腹胀、腹痛、排便性状以及精神状态等。

防止交叉感染： 腹泻患儿的粪便可能含有病原体，操作者需做好自身防护和环境清洁，防止病原体传播。

禁忌和风险：

加重脱水和电解质紊乱： 腹泻本身导致水盐丢失，灌肠特别是使用大量液体可能加剧。

加重肠道炎症和损伤： 腹泻时肠道黏膜脆弱，灌肠刺激可能加重损伤。

引起腹痛和不适： 刺激可能加重腹泻引起的腹部不适。

掩盖病情： 不恰当的灌肠可能干扰医生对腹泻原因的判断。